تعبير بقية الله در قرآن كريم به اين صورت آمده است: بقية الله خير لكم ان كنتم مؤمنين) ( هود 86/11: اگر ايمان داريد، [بدانيد كه) آنچه خداوند [براى شما) باقى گذاشته، برايتان بهتر است) مرحوم علامه طباطبايى )ره( با توجه به اين كه اين عبارت جزو توصيه‏هاى حضرت شعيب )ع( مبنى بر پرهيز از كم فروشى و))) است، مى‏فرمايد: كلمه‏ى »بقيه« به معناى »باقى مانده« است و مراد از آن، سودى مى‏باشد كه پس از پايان معامله براى فروشنده باقى مى‏ماند) آيه اشاره دارد: آن سود و رنجى كه در معاملات مورد قبول خدا باقى مى‏ماند، براى انسان نيكوتر از سودى است كه با گناه و تقلب و حيله به دست مى‏آيد ( ترجمه‏ى تفسير الميزان، ج 10، ص 544، نقل به مضمون)
اما علت اين كه حضرت امام زمان را بقية الله مى‏گويند، اين است كه:
اولا: در پاره‏اى از احاديث اشاره شده كه ايشان باقى مانده‏ى حجت‏های خدا در زمين است) چنان كه از اميرالمؤمنين )ع( روايت شده كه در وصف امام زمان )عج( فرموده است: »بقية من بقايا حجته و خليفة من خلائف انبياءه« ( نهج‏البلاغه، خطبه‏ى 182: باقى مانده‏اى از بقاياى حجت‏هاى خدا و جانشينى از جانشينان پيامبرانش) ؛ ثانيا: در احاديث مربوط به ظهور ايشان آمده است كه در هنگام ظهور، پشت به كعبه مى‏كند و در جمع 313 ياران اول خود قرار مى‏گيرد) اولين چيزى كه مى‏فرمايد، قرائت آيه‏ى: بقية الله خير لكم ان كنتم مؤمنين است) سپس مى‏فرمايد: »أنا بقية الله و حجته و خليفته عليكم«؛ و هر كسى كه مى‏خواهد به او سلام دهد، مى‏گويد: »يا بقية الله فى أرضه«) ( منتخب الأثر، ص 292: امام باقر )ع(:))) فعند ذلك خروج قائمنا، فاذا خرج أسند ظهره الى الكعبه و اجتمع اليه ثلاثمائة و ثلاثة عشر رجلا، فأول ما ينطق به هذه الآية »بقية الله خير لكم ان كنتم مؤمنين«؛ ثم يقول: أنا بقية الله و حجته و خليفته عليكم، فلا يسلم عليه مسلم الا قال: السلام عليك يا بقية الله فى أرضه)خلاصه اين كه: ظاهرا چون ايشان آخرين حجت الهى و باقى مانده‏ى تمامى تلاش‏هاى انبيا و اوليا در راه اشاعه‏ى كلمة الله و برقرارى عدالت در جهان است، ايشان را بقية الله مى‏خوانند)